テキストから3D分子 名前や説明から無料で

化合物名を入力するか、新しい低分子や改変した低分子を説明すると、AI がビューアーで 3D 構造にします。既知の化合物は PubChem から読み込みます。それ以外の場合は AI が SMILES 文字列を書き、ツールが水素を付加して 3D 配座を生成し、MMFF94s 力場で構造最適化してから、結果をボールアンドスティックで開きます。

無料。ご自身の Anthropic または OpenAI のキーを使います。

Also from Innerscene: Circadian Lab, a free lighting calculator for room illuminance, melanopic EML, and glare.

構造の例

ビューアーのサンプルファイルです。AI と同じ情報源(PubChem、Protein Data Bank、Crystallography Open Database、または教科書の格子)から取得しています。

SDF ファイルをダウンロード

動画で使い方を見る

使い方

  1. 1. 文章で説明するか写真を追加作りたいものを普通の言葉で入力します。わかっていればサイズも書き添えてください。参考として写真を追加することもできます。物でも人物でも説明できます。
  2. 2. AI が作成して確認物の場合は AI が OpenSCAD のプログラムを書き、人物の場合はキャラクタージェネレーターを設定します。結果を 6 方向から描画して確認し、おかしな点を修正します。1 回のメッセージにつき最大 5 回作成します。
  3. 3. 仕上げて書き出しモデルは実寸でビューアーに表示されます。チャットで変更を依頼したりスライダーを動かしたりしてから、ダウンロードするか、エクスポート メニューで形式を選びます。

ここで AI を使って作るメリット

  • 既知の化合物は PubChem で検索するため、慣用名、IUPAC 名、医薬品名、商品名のどれでも使えます。
  • 改変した分子や新しい分子、特定の異性体や電荷状態は SMILES から組み立て、分子式、R/S と E/Z の表示、ひずみ、原子の衝突を確認します。
  • AI は各結果の 2D 構造式を依頼内容と照らし合わせ、一致しない場合は構造を修正します。

試せるプロンプト

1 つをクリックすると AI パネルで開きます。サイズは用途に合わせて変更してください。

分子を書き出す

  1. AI パネルのバージョン一覧から SDF をダウンロードします。SMILES から組み立てた分子は、ファイルに SMILES が保存されます。
  2. SDF を Avogadro、PyMOL、ChimeraX などの化学ソフトウェアで開きます。
  3. 3D モデルが必要な場合は、エクスポート メニューを開いて GLB、STL、OBJ、USDZ のいずれかを選ぶか、ビューを PNG で保存します。

SMILES から組み立てた分子は計算によるモデルです。ツールが見つけた最もエネルギーの低い配座で、結晶中やタンパク質に結合したときの形とは異なる場合があります。PubChem の 3D 配座も計算によるモデルです。

おすすめの書き出し形式: GLB, STL, OBJ, PNG

テキストから3D分子 ファイルを無料の テキストから3D分子 ビューアーで開く

知っておきたいこと

対象は低分子のみで、水素を含めて約 600 原子までです。金属錯体は SMILES から組み立てられません。結晶として依頼すると、Crystallography Open Database から取得します。

料金とプライバシー

ご自身の Anthropic または OpenAI の API キーを使います。キーはお使いのブラウザー内にのみ保存され、そのプロバイダーにのみ送信されます。料金はプロバイダーから直接請求されます。目安はモデル 1 つあたり標準品質で $0.05~$0.30、詳細品質で最大約 $1 で、Innerscene からの請求はありません。キーとプロンプトが Innerscene に送信されることはありません。当社が記録するのは、使用したステップ、選んだモデル、トークン数、費用の概算、モデルが作成されたかどうかなどの匿名の利用統計です。

Anthropic または OpenAI の API キーを取得する方法

詳しいガイドを読む:API キー、仕上げ、書き出し

よくある質問

▶テキストからどのように 3D 分子を作るのですか?
名前のある化合物の場合、AI は PubChem で検索して 3D 配座を読み込みます。新しい分子や改変した分子の場合は SMILES 文字列を書き、ツールが 3D 配座を生成して MMFF94s で構造最適化し、最もエネルギーの低いものを残します。
▶3D 構造は正確ですか?
結合長と結合角は MMFF94s 力場に基づき、分子式、立体化学、ひずみ、衝突も確認するため、形状は妥当な計算モデルです。真空中の低エネルギー配座の 1 つなので、実験構造とは異なる場合があります。
▶立体化学は正しく扱われますか?
レポートにはすべての不斉中心と二重結合の R/S と E/Z の表示が載り、AI はそれを依頼内容と照らし合わせます。(S)-イブプロフェンや cis-2-ブテンのように、必要な異性体を名前で指定してください。
▶どのようなファイルが得られますか?
3D 座標、水素、結合次数を含む SDF です。SMILES から組み立てた分子では、SMILES もデータフィールドとして含まれます。エクスポート メニューでは GLB、STL、OBJ、USDZ などの 3D 形式も作成できます。

作成できるもの

平面図とレイアウト

分子、タンパク質、結晶

あらゆる形式のモデルを作成

お使いのアプリ用のモデルを作成

そのほかの使い方

AI 生成ツール