AI-visare för proteinstrukturer Från Protein Data Bank, gratis

Beskriv ett protein, en DNA- eller RNA-struktur eller ett komplex med vanliga ord, så söker AI:n i Protein Data Bank, väljer en matchande post och öppnar den i visaren. Du kan ange ett PDB-ID eller beskriva strukturen: organismen, ett bundet läkemedel eller en ligand, eller den experimentella metoden. Varje struktur som visas är en experimentell post från PDB.

Gratis. Använd din egen nyckel från Anthropic eller OpenAI.

Also from Innerscene: Circadian Lab, a free lighting calculator for room illuminance, melanopic EML, and glare.

En exempelstruktur

En exempelfil från visaren, från samma källor som AI:n använder: PubChem, Protein Data Bank, Crystallography Open Database eller ett gitter från läroboken.

Ladda ner PDB-filen

Se hur det fungerar

Så fungerar det

  1. 1. Beskriv det eller lägg till ett fotoSkriv med vanliga ord vad du vill ha, med mått om du vet dem, eller lägg till ett foto som referens. Beskriv ett föremål eller en person.
  2. 2. AI:n bygger och kontrollerarFör ett föremål skriver AI:n ett OpenSCAD-program, för en person ställer den in karaktärsgeneratorn. Den tittar på sex renderade vyer av resultatet och rättar det som är fel, upp till fem byggen per meddelande.
  3. 3. Förfina och exporteraModellen öppnas i visaren i verklig storlek. Be om ändringar i chatten, flytta reglagen och ladda sedan ner den eller välj ett format i Exportera-menyn.

Därför skapar du den med AI här

  • Inget PDB-ID behövs: AI:n söker utifrån beskrivningen, jämför posterna den hittar efter titel, metod och upplösning och anger vilken den hämtar.
  • Kedjorna ritas som en cartoon, var och en i sin egen färg, med helixar och β-strängar, och bundna ligander, kofaktorer och joner som kula-pinne-modell.
  • DNA och RNA visas som ett rör längs ryggraden med baserna som pinnar, och ett lager med kalottmodell är ett klick bort.

Prompter att prova

Klicka på en för att öppna den i AI-panelen och ändra sedan måtten efter behov.

Så får du ut proteinet

  1. Ladda ner mmCIF-filen från versionslistan i AI-panelen, eller notera PDB-ID:t för att hämta posten någon annanstans.
  2. För en rendering, AR eller en 3D-utskrift öppnar du Exportera-menyn och väljer GLB, USDZ, STL eller ett annat format.
  3. Spara en PNG av vyn, eller en fristående HTML-sida som öppnar proteinet i 3D i vilken webbläsare som helst.

mmCIF-filen är posten så som den publicerats i Protein Data Bank. 3D-exporterna är nät av cartoon och ligander så som de ritas, så ett utskrivet protein behöver oftast stödstrukturer.

Bästa exportformaten: GLB, USDZ, STL, HTML

Öppna AI-visare för proteinstrukturer-filer i den kostnadsfria AI-visare för proteinstrukturer-visaren

Bra att veta

Endast strukturer som har lösts och publicerats i Protein Data Bank kan visas. Verktyget gör ingen strukturprediktion, så ett protein utan experimentell struktur kan inte skapas.

Kostnad och integritet

Du använder din egen API-nyckel från Anthropic eller OpenAI. Den sparas bara i din webbläsare och skickas bara till den leverantören, som fakturerar dig direkt: en modell kostar oftast $0.05 till $0.30 med kvaliteten Standard och upp till cirka $1 med Detaljerad, och Innerscene tar inte betalt. Din nyckel och dina prompter skickas inte till Innerscene; vi registrerar anonym användningsstatistik som vilka steg som användes, vald modell, antal tokens, en kostnadsuppskattning och om en modell skapades.

Så skaffar du en API-nyckel från Anthropic eller OpenAI

Läs hela guiden: API-nycklar, förfining och export

Frågor

▶Var kommer proteinstrukturerna ifrån?
Från Protein Data Bank (RCSB PDB). Varje protein, nukleinsyra och komplex som visas är en experimentell struktur från röntgenkristallografi, kryo-EM eller NMR, hämtad direkt från den publicerade posten.
▶Kan den förutsäga strukturen hos ett nytt protein?
Nej. Verktyget visar strukturer som redan finns i Protein Data Bank och gör ingen veckning eller strukturprediktion.
▶Behöver jag känna till PDB-ID:t?
Nej. Beskriv strukturen så söker AI:n efter den i PDB. Om du känner till ID:t, till exempel 4HHB, anger du det så hämtar AI:n posten direkt.
▶Kan jag öppna mina egna PDB-filer?
Ja. Släpp en .pdb-, .cif-, .pdbqt- eller .pqr-fil i visaren, eller använd den kostnadsfria PDB-visaren. Filerna öppnas i din webbläsare och laddas inte upp.

Vad den kan skapa

Planritningar och planlösningar

Molekyler, proteiner och kristaller

Skapa en modell för valfritt format

Skapa en modell för ditt program

Fler sätt att använda det

AI-generator