Генератор молекул с ИИ Молекулы, белки и кристаллы, бесплатно

Опишите молекулу, белок или кристалл простыми словами, и ИИ найдёт или построит его 3D-структуру, а затем откроет её в бесплатном просмотрщике Innerscene. ИИ никогда не вводит координаты атомов сам: его инструменты загружают реальные структуры из PubChem, Protein Data Bank и Crystallography Open Database или строят новые малые молекулы по SMILES с помощью силового поля. Попросите в чате другую структуру или изменение.

Бесплатно. Используйте свой ключ Anthropic или OpenAI.

Also from Innerscene: Circadian Lab, a free lighting calculator for room illuminance, melanopic EML, and glare.

Пример структуры

Пример файла из просмотрщика, взятый из тех же источников, что использует ИИ: PubChem, Protein Data Bank, Crystallography Open Database или учебная кристаллическая решётка.

Скачать файл mmCIF

Посмотрите, как это работает

Как это работает

  1. 1. Опишите или добавьте фотоНапишите простыми словами, что вам нужно, с размерами, если они известны, или добавьте фото для образца. Опишите предмет или человека.
  2. 2. ИИ строит и проверяет модельДля предмета ИИ пишет программу OpenSCAD, для человека настраивает генератор персонажей. Он смотрит на шесть отрендеренных видов результата и исправляет ошибки, до пяти сборок на одно сообщение.
  3. 3. Доработайте и экспортируйтеМодель открывается в просмотрщике в натуральную величину. Попросите изменения в чате, подвигайте ползунки, затем скачайте её или выберите формат в меню «Экспорт».

Почему стоит создавать модель с ИИ здесь

  • Известные соединения берутся из PubChem, белки, ДНК и комплексы из экспериментальных записей Protein Data Bank, а кристаллы из Crystallography Open Database.
  • Новые или изменённые малые молекулы строятся по SMILES и оптимизируются в силовом поле MMFF94s, затем проверяются брутто-формула, стереохимия, напряжение и перекрывания атомов.
  • Белки открываются в ленточной модели с лигандами в шаростержневом виде, малые молекулы в шаростержневой модели, а слой заполнения пространства показывает каждый атом с его ван-дер-ваальсовым радиусом.

Запросы, которые стоит попробовать

Нажмите на запрос, чтобы открыть его в панели ИИ, затем поменяйте размеры под свою задачу.

Как получить структуру

  1. Скачайте SDF (малые молекулы) или CIF (белки и кристаллы) из списка версий в панели ИИ.
  2. Для 3D-модели откройте меню «Экспорт» и выберите GLB, glTF, OBJ, STL, 3MF, PLY, FBX или USDZ.
  3. Сохраните вид в PNG или как автономную страницу HTML, которая открывает структуру в 3D в любом браузере.

SDF и CIF сохраняют атомы, связи и элементарную ячейку для химических программ. 3D-экспорт создаёт сетки структуры в том виде, в каком она отображена, для рендеров, 3D-печати, AR и презентаций.

Лучшие форматы экспорта: GLB, STL, USDZ, PNG

Открыть файлы Генератор молекул с ИИ в бесплатном просмотрщике Генератор молекул с ИИ

Полезно знать

Белки берутся только из экспериментальных записей Protein Data Bank: белок без опубликованной структуры получить нельзя, потому что инструмент не предсказывает структуры. Молекулы, построенные по SMILES, это расчётные модели, а металлокомплексы, например ферроцен, берутся из кристаллических структур в COD.

Стоимость и конфиденциальность

Вы используете свой API-ключ Anthropic или OpenAI. Он хранится только в вашем браузере и отправляется только этому провайдеру, который выставляет вам счёт напрямую: модель обычно стоит от $0.05 до $0.30 при качестве «Стандартное» и примерно до $1 при качестве «Детальное», а Innerscene ничего не берёт. Ваш ключ и запросы не отправляются в Innerscene; мы собираем анонимную статистику использования: выполненные шаги, выбранную модель ИИ, число токенов, оценку стоимости и то, была ли создана модель.

Как получить API-ключ Anthropic или OpenAI

Полное руководство: API-ключи, доработка и экспорт

Вопросы

▶Генератор молекул с ИИ бесплатный?
Инструмент бесплатный, и Innerscene ничего не берёт. Ваш собственный ключ Anthropic или OpenAI оплачивает провайдеру токены, которые расходует ИИ. PubChem, Protein Data Bank и Crystallography Open Database это бесплатные общедоступные базы данных.
▶ИИ придумывает координаты атомов?
Нет. ИИ выбирает название соединения, строку SMILES, запись Protein Data Bank или запись кристалла, а его инструменты загружают или строят координаты. Затем ИИ читает отчёт и, для малых молекул, 2D-изображение, чтобы убедиться, что структура соответствует запросу.
▶Структуры экспериментальные?
Белки, нуклеиновые кислоты и комплексы это экспериментальные структуры из Protein Data Bank, и кристаллы, загруженные из Crystallography Open Database, тоже экспериментальные. Молекулы, построенные по SMILES, это расчётные модели из силового поля, а учебные решётки, например каменной соли, идеализированы.
▶Можно ли открыть файлы в других химических программах?
Да. Малые молекулы скачиваются в SDF, а белки и кристаллы в mmCIF или CIF, которые открывают PyMOL, ChimeraX, Avogadro, VESTA и большинство других химических программ.

Что он умеет создавать

Планы этажей и планировки

Молекулы, белки и кристаллы

Модель для любого формата

Модель для вашей программы

Другие способы применения

ИИ-генератор