Visualizzatore di strutture proteiche con IA Dalla Protein Data Bank, gratis

Descrivi una proteina, una struttura di DNA o RNA o un complesso con parole semplici, e l’IA cerca nella Protein Data Bank, sceglie una voce corrispondente e la apre nel visualizzatore. Puoi indicare un ID PDB, oppure descrivere la struttura: l’organismo, un farmaco o un ligando legato, o il metodo sperimentale. Ogni struttura mostrata è una voce sperimentale della PDB.

Gratis. Usa la tua chiave Anthropic o OpenAI.

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Una struttura di esempio

Un file di esempio del visualizzatore, dalle stesse fonti che usa l’IA: PubChem, la Protein Data Bank, la Crystallography Open Database o un reticolo da libro di testo.

Scarica il file PDB

Guarda come funziona

Come funziona

  1. 1. Descrivilo o aggiungi una fotoScrivi ciò che vuoi con parole semplici, con le misure se le conosci, oppure aggiungi una foto come riferimento. Descrivi un oggetto o una persona.
  2. 2. L’IA lo costruisce e lo controllaPer un oggetto l’IA scrive un programma OpenSCAD, per una persona configura il generatore di personaggi. Esamina sei viste renderizzate del risultato e corregge ciò che non va, fino a cinque costruzioni per messaggio.
  3. 3. Perfeziona ed esportaIl modello si apre nel visualizzatore a grandezza reale. Chiedi modifiche nella chat, sposta i cursori, poi scaricalo o scegli un formato dal menu Esporta.

Perché crearlo con l’IA qui

  • Non serve un ID PDB: l’IA cerca in base alla descrizione, confronta le voci trovate per titolo, metodo e risoluzione, e indica quella che carica.
  • Le catene sono disegnate come cartoon, ciascuna con il suo colore, con eliche e filamenti, e ligandi, cofattori e ioni legati a sfere e bastoncini.
  • DNA e RNA appaiono come un tubo lungo lo scheletro con le basi come bastoncini, e un layer a riempimento spaziale è a un clic di distanza.

Prompt da provare

Fai clic su uno per aprirlo nel pannello IA, poi adatta le misure alle tue esigenze.

Esportare la proteina

  1. Scarica l’mmCIF dall’elenco delle versioni nel pannello IA, oppure annota l’ID PDB per scaricare la voce altrove.
  2. Per un render, l’AR o una stampa 3D, apri il menu Esporta e scegli GLB, USDZ, STL o un altro formato.
  3. Salva un PNG della vista, oppure una pagina HTML autonoma che apre la proteina in 3D in qualsiasi browser.

L’mmCIF è la voce così come è pubblicata nella Protein Data Bank. Le esportazioni 3D sono mesh del cartoon e dei ligandi così come sono disegnati, quindi una proteina stampata di solito richiede supporti.

Formati di esportazione consigliati: GLB, USDZ, STL, HTML

Apri i file Visualizzatore di strutture proteiche con IA nel visualizzatore Visualizzatore di strutture proteiche con IA gratuito

Buono a sapersi

Si possono mostrare solo strutture risolte e pubblicate nella Protein Data Bank. Lo strumento non fa previsione della struttura, quindi una proteina senza una struttura sperimentale non si può creare.

Costi e privacy

Usi la tua chiave API Anthropic o OpenAI. È salvata solo nel tuo browser e viene inviata solo a quel fornitore, che ti fattura direttamente: un modello costa di solito da $0.05 a $0.30 in qualità Standard e fino a circa $1 in qualità Dettagliata, e Innerscene non applica alcun costo. La tua chiave e i tuoi prompt non vengono inviati a Innerscene; registriamo statistiche d’uso anonime come i passaggi usati, il modello scelto, il numero di token, una stima del costo e se è stato creato un modello.

Come ottenere una chiave API di Anthropic o OpenAI

Leggi la guida completa: chiavi API, perfezionamento ed esportazione

Domande

▶Da dove provengono le strutture proteiche?
Dalla Protein Data Bank (RCSB PDB). Ogni proteina, acido nucleico e complesso mostrato è una struttura sperimentale ottenuta per cristallografia a raggi X, crio-EM o NMR, caricata direttamente dalla voce pubblicata.
▶Può prevedere la struttura di una nuova proteina?
No. Lo strumento mostra strutture che esistono già nella Protein Data Bank e non fa ripiegamento né previsione della struttura.
▶Devo conoscere l’ID PDB?
No. Descrivi la struttura e l’IA la cerca nella PDB. Se conosci l’ID, per esempio 4HHB, indicalo e l’IA carica direttamente quella voce.
▶Posso aprire i miei file PDB?
Sì. Trascina un file .pdb, .cif, .pdbqt o .pqr sul visualizzatore, oppure usa il visualizzatore PDB gratuito. I file si aprono nel tuo browser e non vengono caricati online.

Cosa può creare

Piante e layout

Molecole, proteine e cristalli

Crea un modello per qualsiasi formato

Crea un modello per la tua app

Altri modi per usarlo

Generatore IA