Convertir PDB en PLY (Gratuit)
Convertit aussi en STL, OBJ, GLB, USDZ, 3MF, FBX depuis le même fichier.
Fonctionne dans votre navigateur. Sans téléversement, sans inscription, sans rien à installer.
Également chez Innerscene : Circadian Lab, un calculateur d’éclairage gratuit pour l’éclairement d’une pièce, l’EML mélanopique et l’éblouissement.
Comment convertir PDB en PLY
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Ouvrez votre fichier .pdb
Glissez-le sur le visualiseur ci-dessus, ou cliquez sur "Ouvrir un fichier PDB". Les fichiers jusqu’à 200 Mo s’ouvrent directement ; l’analyse tourne dans un worker, la page reste donc réactive.
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Cliquez sur Télécharger le PLY
Une fois le fichier ouvert, le bouton Télécharger le PLY se trouve en bas à droite de la visionneuse. Le menu Exporter de la barre d’outils propose tous les autres formats.
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Téléchargez
Le .ply est écrit dans le navigateur et enregistré directement dans vos téléchargements. Sans file d’attente, sans e-mail, sans filigrane.
Ce qui survit à la conversion
Une conversion est une traduction, et les formats ne portent pas les mêmes choses. Voici exactement ce qui passe de PDB à PLY, et ce qui ne passe pas.
| Géométrie | Conservé | Les deux formats stockent maillages triangulaires, donc la forme se transfère directement. |
|---|---|---|
| Couleurs et matériaux | Conservé | PLY porte couleur par sommet, soit au moins ce que stocke PDB, donc les couleurs passent. |
| Calques et structure | Perdu | PLY est un seul corps plat, sans calques ni pièces nommées. Tout fusionne en un objet. Si vous avez besoin de la structure, exportez plutôt en GLB, OBJ, DXF. |
| Unités et échelle | Réduit | Les coordonnées PDB sont en ångströms, et l’export compte un ångström pour un mètre : une protéine de 50 Å de large arrive avec 50 mètres de large. Mettez le modèle à l’échelle voulue à l’import. |
Ce que le générateur PLY produit : PLY binaire little-endian avec x/y/z et RVB par sommet, des faces pour les maillages, des arêtes pour les tracés, uniquement des sommets pour les nuages.
La source : Protein Data Bank structure (PDB) (.pdb, .ent, .pdbqt, .pqr)
Une structure de la Protein Data Bank (ainsi que PDBQT d’AutoDock et PQR d’APBS) en ångströms : les protéines en cartoon de leurs chaînes avec hélices et brins, l’ADN et l’ARN en tube le long du squelette avec les bases en bâtonnets, les ligands en boules et bâtonnets, chaque atome coloré selon son élément, avec les atomes du polymère, les hydrogènes, l’eau et le modèle compact sur des calques à part. Le premier modèle du fichier est lu.
La cible : Polygon File Format (.ply)
Le format de la numérisation et de la photogrammétrie, et le seul format d’échange qui traite les nuages de points comme des citoyens de première classe.
S’ouvre dans : CloudCompare, MeshLab, Blender, Metashape, RealityCapture.
Votre fichier ne quitte jamais votre ordinateur
L’analyseur PDB comme le générateur PLY sont du JavaScript et du WebAssembly qui tournent dans votre propre onglet. Pas d’étape de téléversement, pas de file de conversion côté serveur, aucune copie de votre fichier ailleurs que sur votre machine. Cela compte pour des plans sous NDA, pour du travail client, et pour tout ce que vous n’enverriez pas par e-mail à un inconnu.
Questions fréquentes
▶Ce convertisseur PDB vers PLY est-il gratuit ?
Oui. Sans inscription, sans filigrane, sans limite par fichier et sans offre payante. Innerscene.
▶Mon fichier PDB est-il téléversé quelque part ?
Non. Le fichier est lu avec l’API fichier du navigateur et converti dans le même onglet. Rien n’est envoyé à un serveur tant que vous ne cliquez pas explicitement sur Partager, qui est une fonction distincte et facultative.
▶Mes couleurs et matériaux survivront-ils à l’export PLY ?
PLY porte couleur par sommet, soit au moins ce que stocke PDB, donc les couleurs passent.
▶Les calques et les pièces nommées passent-ils dans le fichier PLY ?
PLY est un seul corps plat, sans calques ni pièces nommées. Tout fusionne en un objet. Si vous avez besoin de la structure, exportez plutôt en GLB, OBJ, DXF.
▶Le PLY s’ouvrira-t-il à la bonne taille ?
Les coordonnées PDB sont en ångströms, et l’export compte un ångström pour un mètre : une protéine de 50 Å de large arrive avec 50 mètres de large. Mettez le modèle à l’échelle voulue à l’import.
▶Quelle taille de fichier PDB puis-je convertir ?
Jusqu’à 200 Mo, et le plafond s’adapte à la mémoire annoncée par votre appareil. La conversion tourne sur votre propre matériel : un ordinateur de bureau bien doté en RAM ira plus loin qu’un téléphone.
▶Puis-je reconvertir PLY en PDB ?
Pas ici. Nous lisons PDB et écrivons PLY, mais pas l’inverse. visualiseur 3D universel
▶Dans quels navigateurs cela fonctionne-t-il ?
Chrome, Edge, Firefox et Safari, sur Windows, macOS, Linux, iOS et Android. Sans plugin ni extension.
Convertir PDB vers un autre format
Convertir un autre format en PLY
Ou partez du visualiseur 3D universel.